دبیرخانه شورای عالی انقلاب فرهنگی با هدف فراهم آوردن زمینه های لازم درجهت کارشناسی هرچه بهتر مصوبات شورای عالی و پشتیبانی علمی، پژوهشی و خدماتی متناسب با وظایف و مسئولیت های آن و همچنین بهره برداری از اطلاعات و تحقیقات انجام شد به منظور تصمیم سازی مناسب به عنوان موسسه پژوهشی تشکیل شده و وظایف زیر را دارد:
– ایجاد ارتباط و همکاری با مراکز، موسسات و شوراها و انجمن های علمی و نهادهای فرهنگی و ارزیابی فعالیت ها و عملکرد آن ها در چارچوب ضوابط‌ تعیین شده توسط شورای عالی و ارائه گزارش های لازم
– انجام مطالعات، تحقیقات و پژوهش های مورد نظر شورای عالی و ارائه نظریات کارشناسی و مشورتی
– تهیه و تدوین طرح ها و ارائه پیشنهادهای مورد نیاز برای تسهیل در تحقق اهداف و وظایف شورای عالی
– بررسی و اظهار نظر در رابطه با طرح ها و پیشنهادهای واصله از کلیه مراکز و موسسات فرهنگی، تبلیغاتی و آموزشی و صاحب نظران فرهنگی
– شناخت نیازهای فکری و معرفتی جامعه و شناسایی مظاهر فرهنگی و تدوین و طراحی شیوه های راهبردی برای ارائه به شورای عالی
– بررسی و شناخت جریان های فرهنگی جهان و شناساندن کانون های تاثیرگذار در جامعه به شورای عالی

عرصه های ماموریتی شورای عالی انقلاب فرهنگی در چارچوب معارف قرآن کریم و سیره و سنت اهل بیت (علیهم السلام) بر‌ مبنای موضوعات و اولویت های مندرج در احکام مقام معظم رهبری (مدظله العالی) به شرح ذیل تعیین و احصا می‌گردد:
1. تمدن نوین اسلامی
2. تعلیم و تربیت اسلامی
3. فرهنگ عمومی
4. علم، فناوری و نوآوری
5. امور دینی
6. خانواده و زنان
7. امور اجتماعی
8. ترویج و تبیین قرآن کریم و سیره و سنت اهل بیت (علیهم السلام)
9. اخلاق، معنویت و شعائر دینی
10. مهندسی فرهنگی و اقتصاد فرهنگ
11. محتوای فرهنگی و اجتماعی فضای مجازی
12. تعاملات بین المللیِ فرهنگی و علمی