اندیشکده نظام مسائل حکمرانی کشور با هدف اثربخشی برای شناخت ،تبیین و حل مسائل کلان حکمرانی کشور و به منظور شناسایی و اولویت بخشی به احصا ظرفیت ها و حل موانع پیش روی آینده کشور و اصلاح ساختار نظام تصمیم گیری و حکمرانی با تکیه بر ظرفیت جامعه علمی و پژوهشی و خلق راهکارهای سیاستی و علمی- اجرایی جهت برون رفت از موانع و ابرچالش های کشور تشکیل شده است.

1. انجام تحقیقات علمی و کاربردی در خصوص نظام مسائل و حکمرانی و اصلاح ساختارهای تصمیم گیری و اداری کشور و ارایه راهکارهای اجرایی و علمی به مسئولان اجرایی در کشور.
2. احصا ظرفیت های مغفول مانده کشور در گام اول انقلاب وتهیه پیوست های علمی جهت فعال نمودن آن ها در گام دوم انقلاب.
3. حمایت و بهره مندی از تولیدات و خلق پژوهش های کاربردی در راستای مسائل کلان حکمرانی کشور.
4. تشکیل هسته های علمی ، نشست ها و میزهای تخصصی در راستای حل مسائل حکمرانی و ابرچالش های ملی .
5. چاپ و انتشار دستاوردهای تولیدی اندیشکده در قالب گزارشات راهبردی، بولتن ها و… .