سعیده بابایی دارای مدرک کارشناسی ارشد در رشته مهندسی سیستم های انرژی و مدرک دکتری در رشته فلسفه علم و فناوری از پژوهشگاه علوم انسانی و مطالعات فرهنگی است. وی در حال حاضر پژوهشگر مرکز پژوهشی آرا است. سعیده بابایی در زمینه‌هایی همچون فلسفه علم صاحب نظر است.