اندیشکده بانوان جهاد دانشگاهی واحد الزهرا (س) ذیل معاونت پژوهشی این واحد فعالیت می‌کند. در دنیای امروز، فرایند سیاستگذاری و تصمیم‌گیری در سطوح مختلف به سازماندهی ویژه‌ای نیاز دارد. تحولات سریع جهانی و ابعاد روزافزون توسعه از عواملی هستند که ضرورت تدوین سریع سیاست‌ها و الگوهای تصمیم‌گیری را به ویژه در کشورهای در حال توسعه مشخص می‌کنند. از این رو، سازمان‌های بزرگ برنامه‌ریز در این فضای پیچیده به جز معاونت‌ها و ادارات مختلف برنامه‌ریز که اغلب مشغول کار اجرایی هستند، نیازمند فضایی هستند که به ایده‌پردازی، آینده‌پژوهی و تصمیم‌سازی بپردازند. چنین فضاهایی تحت عنوان اندیشکده به بررسی و پژوهش درباره مسائل مختلف جامعه پرداخته و برای آنها راهکار ارائه می‌دهند. این اندیشکده‌ها از یک سو به مراکز علمی و آکادمیک پیوند می‌خورند و از سوی دیگر با حوزه سیاست‌گذاری در ارتباط هستند و همین امر آنها را از نهادهای صرفا سیاسی یا آکادمیک متمایز کرده و قدرت تأثیرگذاری آنان را افزایش می‌دهد.
یکی از مسائلی که نیازمند چنین رسیدگی ای است مسائل مربوط به بانوان می باشد. پررنگ کردن نقش بانوان در پیشرفت کشور نیازمند تمرکز بر مسائل متفاوتی از جمله توانمندسازی و سلامت اجتماعی تحکیم خانواده تعالی جایگاه خانواده، فرزندآوری و تمدن اسلامی است که در مرکز فعالیت‌های این اندیشکده قرار دارد.

ماموریت اصلی اندیشکده عبارت است از:
– اندیشه ورزی،
– بازتولید و ترویج گفتمان عاملیت بانوان در تحقق کشوری پیشرفته،
– حلقه واسط میان مجامع علمی و مراجع تصمیم‌گیری کشور در حوزه زنان.